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相关适应度景观上的贪心适应性游走

种群与进化 2016-03-21 v2 统计力学

摘要

我们研究单倍体无性种群在定义于长度为 LL 的二进制基因型序列上的适应度景观中的适应过程。我们考虑贪心适应性游走,其中种群移动至当前基因型的所有单突变邻居中最适应的一个,直至达到局部适应度最大值。该景观属于粗糙富士山类型,意味着分配给序列的适应度值是随机分量与确定性分量之和。随机分量是独立同分布的随机变量,确定性分量随距参考序列的距离线性变化。确定性适应度梯度 cc 是一个参数,在非相关随机景观(c=0c = 0)和有效加性景观(cc \to \infty)的极限之间进行插值。当随机适应度分量选自 Gumbel 分布时,获得了贪心游走步数分布的显式表达式,并表明当起点足够接近参考序列时,游走长度随适应度梯度强度呈非单调变化。利用极值理论获得了随机适应度分量服从一般分布时的渐近结果,并发现如果 cc 以适当的组合方式随 LL 缩放,则游走长度在 LL \to \infty 时达到一个非平凡极限,该极限不同于 c=0c=0c=c = \infty 时的值。

关键词

引用

@article{arxiv.1507.03511,
  title  = {Greedy adaptive walks on a correlated fitness landscape},
  author = {Su-Chan Park and Johannes Neidhart and Joachim Krug},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1507.03511},
  year   = {2016}
}

备注

minor changes