生物通路可视化的图模型：现状与未来挑战
人机交互
2021-10-12 v1
摘要
多层网络的概念近来已融入复杂系统建模，因其囊括了复杂关系的非常一般的概念。生物通路是复杂现实世界网络的一个例子，其中顶点表示生物实体，边表示底层连接。因此，使用多层网络对生物知识建模使我们能够形式化地涵盖该领域的基本属性与理论，这也给可视化带来了挑战。这是因为，在通路可视化研究的早期，仅采用了受限类型的图，如简单图、聚类图等。本文中，我们重新审视生物网络的异质定义，旨在提供概览以审视数据建模与视觉表征之间的鸿沟。因此，贡献在于为使用多层网络作为生物通路可视化的统一数据结构提供指导与挑战。
引用
@article{arxiv.2110.04808,
title = {Graph Models for Biological Pathway Visualization: State of the Art and Future Challenges},
author = {Hsiang-Yun Wu and Martin Nöllenburg and Ivan Viola},
journal= {arXiv preprint arXiv:2110.04808},
year = {2021}
}