使用动力学晶格模型对蛋白质进行全局优化:基态与能量景貌
生物大分子
2015-06-26 v3
摘要
提出一种研究蛋白质结构的简单方法。利用低复杂度模型、简单成对相互作用和全局优化概念,我们能够计算与实验数据一致的蛋白质基态。在特定能量阈值以下可获得小蛋白质的所有可能模型结构。给出了trp cage蛋白(1L2Y)的精确低能景貌,显示了所有状态的连通性和能垒。
引用
@article{arxiv.q-bio/0412031,
title = {Global optimization of proteins using a dynamical lattice model: Ground states and energy landscapes},
author = {F. Dressel and S. Kobe},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0412031},
year = {2015}
}
备注
8 pages, 5 figures, changed title and content, Chemical Physics Letters (in press)