GlnK 促进细菌氮同化的动态调控
亚细胞过程
2017-06-28 v1 定量方法
摘要
大肠杆菌中的铵同化受两个旁系同源蛋白 (GlnB 和 GlnK) 调控，它们协调与基因表达调控因子、转运蛋白和代谢途径的相互作用。然而，它们如何共同调节氮同化的关键酶谷氨酰胺合成酶 (GS) 的活性尚不清楚。我们结合实验和理论研究了 GlnB 和 GlnK 在氮饥饿和氮激增期间的动态作用。我们测量了代谢物、总蛋白及翻译后修饰蛋白的时间分辨体内浓度，并开发了一个简明的 GlnB 和 GlnK 生化模型，该模型 Incorporates 对活性和变构位点的竞争以及 GlnK 的功能性隔离。该模型预测了野生型和两种基因敲除株在随时间变化的外部铵水平下 GS、GlnB 和 GlnK 的响应。我们的结果表明，GlnK 在富氮条件下受到严格调控，但在铵耗尽和饥饿期间表达。这表明 GlnK 在饥饿后作为氮冲击的缓冲器发挥作用，并为氮代谢和碳代谢之间提供了进一步的功能联系。
引用
@article{arxiv.1704.05942,
title = {GlnK facilitates the dynamic regulation of bacterial nitrogen assimilation},
author = {Adam Gosztolai and Jörg Schumacher and Volker Behrends and Jacob G Bundy and Franziska Heydenreich and Mark H Bennett and Martin Buck and Mauricio Barahona},
journal= {arXiv preprint arXiv:1704.05942},
year = {2017}
}