基因表达噪声中组合调控的动态相关性的几何特征
定量方法
2015-05-13 v2
摘要
了解一个基因采用的组合调控模式（通常是AND或OR逻辑运算）对于确定其在调控网络中的功能至关重要。在这里，我们引入了一个基因输出与其上游调控因子浓度之间的动态互相关函数，用于在基因表达噪声中寻找组合调控的特征。我们发现，对于AND运算，相关函数总是向上凸的，而对于OR运算则是向下凸的，无论噪声来源（内在或外在或两者兼有）如何。反过来，这一事实意味着一种从现有实验数据推断调控协同性的方法。讨论了其扩展和应用。
引用
@article{arxiv.0904.2676,
title = {Geometric Characteristics of Dynamic Correlations for Combinatorial Regulation in Gene Expression Noise},
author = {Jiajun Zhang and Zhanjiang Yuan and Tianshou Zhou},
journal= {arXiv preprint arXiv:0904.2676},
year = {2015}
}
备注
4 pages, 3 figures, and supporting material