快速适应种群的谱系

物种的遗传多样性由其近期的进化历史塑造，可用于推断人口统计事件或选择性清除。大多数推断方法基于自然选择是一种微弱或罕见的进化力量这一零假设。然而，许多物种，特别是病原体，面临着因环境变化而持续适应的压力。目前缺乏针对此类种群多样性数据进行推断的统计框架。为此，我们探讨了无性种群持续适应模型中谱系的性质。我们表明，谱系可追溯至少量高适应度祖先组成的群体，其中经常发生两个以上谱系的几乎同时合并。虽然这种多重合并在中性合并过程中不太可能发生，但它们在适应种群中创造了独特的遗传印记。例如，衍生中性等位基因的位点频率谱是非单调的，并在高频处出现峰值，而 Tajima's D 随着样本量的增加变得越来越负。由于多重合并合并过程出现在许多快速适应模型中，我们认为它们应被视为适应种群的零模型。