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基因沉默与大肠杆菌基因组的大尺度结构域结构

基因组学 2012-10-01 v1

摘要

大肠杆菌中的 H-NS 染色体组织蛋白能够稳定基因组 DNA 环,并形成与基因表达抑制相关的寡聚结构。受染色体组织、蛋白质结合与基因表达之间联系的启发,我们分析了各种来源的公开基因组数据集,从全基因组蛋白质结合谱到进化信息,探讨了染色体组织、基因沉默、假基因定位和水平基因转移之间的联系。我们报告了转录沉默连续区域的存在,这些区域对应于沿基因组的大片 H-NS 蛋白结合区,它们的位置表明与已知的染色体组织大尺度特征可能存在关系。

关键词

引用

@article{arxiv.1209.6513,
  title  = {Gene silencing and large-scale domain structure of the E. coli genome},
  author = {Mina Zarei and Bianca Sclavi and Marco Cosentino Lagomarsino},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1209.6513},
  year   = {2012}
}