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质子化咪唑二聚体 51 维势能面的高斯过程模型

计算物理 2020-08-27 v4 化学物理

摘要

本工作的目标是以与系统无关的方式,用少量 ab{\it ab} initio{\it initio} 计算获得高维分子系统的精确势能面(PES)。我们使用基于高斯过程(GPs)的概率建模。我们说明,基于 50005000 个随机分布的 ab{\it ab} initio{\it initio} 计算,以全局精度 <0.2< 0.2 kcal/mol 构建一个 51 维 PES 的精确 GP 模型是可能的。我们的方法使用带有复合核的 GP 模型,旨在增强贝叶斯信息内容,并将全局 PES 表示为一个全维 GP 与若干个低维分子片段 GP 模型之和。我们通过构建具有 1919 个原子的分子系统质子化咪唑二聚体的全局 PES 来展示这些算法的效力。我们说明如此构建的 GP 模型能从低能(<10,000< 10,000 cm1^{-1})外推 PES,从而得到高能(>20,000> 20,000 cm1^{-1})处的 PES。这为 GPs 的新应用开辟了前景,例如通过外推绘制相变图或加速贝叶斯优化,用于训练数据获取极为困难的高维物理与化学问题(即输入受限的高维问题)。

关键词

引用

@article{arxiv.2001.07271,
  title  = {Gaussian process model of 51-dimensional potential energy surface for protonated imidazole dimer},
  author = {Hiroki Sugisawa and Tomonori Ida and Roman V. Krems},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2001.07271},
  year   = {2020}
}

备注

24 pages, 5 figures