FANCA：用于白血病早期预测的计算机有害突变分析
定量方法
2021-11-01 v2
摘要
作为范可尼贫血互补群（FANC）家族的新颖生物标志物，FANCA是白血病的抗原。FANCA的过表达预示了世界上第二常见的、导致癌症相关死亡的癌症。非同义SNP是一类导致编码多肽改变的的重要SNP。基因产物氨基酸序列的改变导致白血病。首先，我们研究FANCA编码区中的个体SNP，并使用PROVEAN、PolyPhen2、MuPro和PANTHER等计算工具计算有害突变分数。使用I-TASSER进行三维结构与功能预测。进一步使用GlaxyWeb工具对预测结构进行精炼。研究中，蛋白质组数据从UniProtKB获取。数据集的编码区包含100个非同义单核苷酸多态性（nsSNP），其中24个错义SNP被所有分析确定为有害。本工作采用六种知名计算工具研究白血病相关的nsSNP。推断这些nsSNP可能在FANCA上调中发挥作用，进而促使白血病进展。当前研究将有益于研究人员与从业者处理FANCA相关的癌症关联疾病。所提研究也将有助于在药物发现领域发展精准医疗。
引用
@article{arxiv.2107.09056,
title = {FANCA: In-Silico deleterious mutation analysis for early prediction of leukemia},
author = {Madiha Hameed and Abdul Majiid and Asifullah Khan},
journal= {arXiv preprint arXiv:2107.09056},
year = {2021}
}
备注
22 pages, 09 figure