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纳米级膜系绳的超额面积依赖标度行为

生物物理 2016-10-25 v1 介观与纳米尺度物理 软凝聚态物质 统计力学 计算物理

摘要

细胞膜中的热涨落表现为超额面积 (Aex{\cal A}_{\rm ex}),它支配着亚微米尺度上的多种物理过程。我们提出了一个理论框架,基于计算机模拟 (in silico) 的系绳拉伸方法,可用于可靠地估算活细胞中的Aex{\cal A}_{\rm ex}。我们从模拟中估算的系绳力与我们对从破裂的巨大单层囊泡 (GUVs) 和 HeLa 细胞中提取的系绳的实验测量结果吻合良好。通过展示我们所有的计算以及针对 15 种不同细胞类型的系绳提取实验均坍缩到两个统一的标度关系上(映射系绳力、系绳半径、弯曲刚度κ\kappa和膜张力σ\sigma),我们证明了该方法的重要性和有效性。我们表明,润湿区域的大小RbeadR_{\rm bead}是决定提取系绳半径的重要因素:当Rbead<ξR_{\rm bead}<\xi时,系绳半径等于ξ=κ/2σ\xi=\sqrt{\kappa/2\sigma}(膜的特征长度尺度);当Rbead>ξR_{\rm bead}>\xi时,系绳半径等于RbeadR_{\rm bead}。我们还发现,估算的超额面积遵循线性标度行为,该行为仅取决于膜的真实Aex{\cal A}_{\rm ex}值;基于此,我们提出了一种自洽技术来估算细胞中超额膜面积的范围。

关键词

引用

@article{arxiv.1610.07099,
  title  = {Excess area dependent scaling behavior of nano-sized membrane tethers},
  author = {N. Ramakrishnan and Arpita Roychoudhury and David M. Eckmann and Portnovo S. Ayyaswamy and Tobias Baumgart and Thomas Pucadyil and Shivprasad Patil and Valerie M. Weaver and Ravi Radhakrishnan},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1610.07099},
  year   = {2016}
}

备注

29 pages, 9 main figure, 8 supplementary figures