生物分子溶液中与构象及密度涨落关联的熵
统计力学
2023-03-02 v1
摘要
基于吉布斯熵公式以及结合 RISM/3D-RISM 理论的广义朗之万理论，推导了描述生物分子溶液熵的微观公式。推导出两个公式：一个关于生物分子的构象涨落，另一个关于溶质周围溶剂的密度涨落。所推导的与构象涨落关联熵的公式为，其中 N 为溶质中原子数，A 为构象涨落方差-协方差矩阵之逆的行列式。还推导了溶质周围一对位置上溶剂熵的公式，其中 n 为溶剂分子中原子数，B 本质上为密度对关联函数矩阵的行列式。局域位置 r 处的熵可通过将该表达式对系统整个体积积分得到。讨论了求解这些熵的计算可行性。
引用
@article{arxiv.2303.00278,
title = {Entropy associated with conformation and density fluctuations in biomolecular solutions},
author = {Fumio Hirata},
journal= {arXiv preprint arXiv:2303.00278},
year = {2023}
}