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拓扑约束对球状聚合物的影响

软凝聚态物质 2014-12-12 v2 生物物理 生物大分子

摘要

拓扑约束会影响聚合物系统的平衡态和动力学性质,并可能在染色体组织中发挥作用。尽管已有许多理论研究,但拓扑约束对单个致密聚合物平衡态的影响尚未得到系统研究。在此,我们利用模拟来解决这一长期存在的问题。我们发现,足够长的无结聚合物与有结聚合物在其子链的空间和拓扑状态上存在差异。无结球状体的子链大多是无结的,并形成渐近致密的 RG(s)s1/3R_G(s) \sim s^{1/3} 皱褶。然而,这些皱褶表现出较高的表面分形维数 db=2.8d_b = 2.8,形成过多的接触并相互穿透。我们得出结论,这种受拓扑约束的平衡态类似于推测的皱褶球状体 [Grosberg et al., Journal de Physique, 1988, 49, 2095],但不同于其理想的自相似、孤立且致密的皱褶层级结构。

关键词

引用

@article{arxiv.1404.0763,
  title  = {Effects of topological constraints on globular polymers},
  author = {Maxim Imakaev and Konstantin Tchourine and Sergei Nechaev and Leonid Mirny},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1404.0763},
  year   = {2014}
}