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静态与时间涨落张力对半柔性聚合物环化的影响

软凝聚态物质 2012-02-07 v1 生物大分子

摘要

生物聚合物环化是一个在细胞中普遍发生的动态过程,用于基因调控、蛋白质折叠等。在细胞环境中,生物聚合物通常受到静态或远离平衡的时间涨落张力。我们通过使用布朗动力学模拟结合解析理论,研究了在此类张力存在时半柔性聚合物环化的动力学。我们表明,微小的张力会极大地改变环化时间,特别是对于长链。将二态翻转噪声作为非平衡张力的一个简单例子,我们发现了共振激活现象,其中环化时间在最佳翻转时间处达到最小值。我们结合近期的实验讨论了我们的结果。

关键词

引用

@article{arxiv.1112.0450,
  title  = {Effects of static and temporally fluctuating tensions on semiflexible polymer looping},
  author = {Jaeoh Shin and Wokyung Sung},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1112.0450},
  year   = {2012}
}

备注

7 pages, 8 figures, accepted in the Journal of Chemical Physics