微管力学对水解和灾变的影响
亚细胞过程
2014-12-12 v1 软凝聚态物质
生物物理
摘要
我们引入了一种微管力学模型,该模型包含相邻原纤维间二聚体的横向键、二聚体的弯曲刚度以及模拟空间位阻约束的原纤维间排斥相互作用,旨在探究机械力对水解和灾变的影响。我们采用变构二聚体模型,其中微管蛋白二聚体由平衡弯曲角表征,该角度因二聚体水解而从 变为 。这也会影响横向相互作用能和弯曲能,从而改变微管的力学平衡状态。由于水解引起二聚体的构象变化,机械力也会通过改变机械能来调节水解速率,进而影响水解速率。通过微管力学产生的相互作用导致了水解动力学中的关联效应,而此前的研究尚未考虑这一点。假设机械能对水解速率起主导影响,我们研究了矢量水解和随机水解两种情况下最可能的水解路径。通过研究相对于横向键断裂的稳定性,我们确定了沿水解路径的灾变起始构型以及横向键断裂力的数值。如果允许相邻原纤维间二聚体的横向键在超过该阈值力时断裂,我们的模型会表现出雪崩式的灾变事件。
引用
@article{arxiv.1406.1292,
title = {Effects of microtubule mechanics on hydrolysis and catastrophes},
author = {Nina Müller and Jan Kierfeld},
journal= {arXiv preprint arXiv:1406.1292},
year = {2014}
}