不同金属阳离子在浓度和温度变化下对PolyrA·PolyrU构象转变的影响
生物物理
2009-04-28 v1 化学物理
摘要
基于平衡结合模型的理论,计算了在含有Mg2+、Ni2+、Cd2+以及0.1 M Na+的poly rA·poly rU体系中的相图。确定了结合常数(KA、KU、KAU、KA2U),观察到与早期实验结果的最佳一致性。结果表明,如果使用所有上述结构的多核苷酸与离子结合的稳态平均常数,则使用Mg2+计算的相图可以获得令人满意的结果。但在Ni2+和Cd2+的情况下,必须考虑常数对离子浓度的依赖性,尤其是在高离子含量时,此时会出现单链poly A分子的压缩。研究发现,导致Ni2+和Cd2+相图差异的主要因素是它们与poly A结合常数的显著变化。通过紫外光谱获得的低聚合物浓度下构象转变的温度依赖性,与通过红外和振动圆二色光谱在高浓度这些分子以及相应高浓度金属离子溶液中获得的结果进行了比较。阐明了导致先前观察到的非比例2→3转变不可逆性的差异和特性。
引用
@article{arxiv.0904.4100,
title = {Effects of different metal cations on conformational transitions in PolyrA PolyrU under concentration and temperature changes},
author = {Yu. P. Blagoi and S. A. Egupov and E. L. Usenko and V. A. Sorokin},
journal= {arXiv preprint arXiv:0904.4100},
year = {2009}
}
备注
10 pages, 6 figures