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两态蛋白质折叠动力学中的协同性

神经元与认知 2007-05-23 v2 种群与进化

摘要

我们提出一个可解模型,由其天然结构预测两态蛋白质的折叠动力学。该模型基于条件链熵,假设折叠过程由可从天然结构推断的小环闭合事件主导。对于 CI2、src SH3 域、TNfn3 和 protein L,该模型复现了两态动力学,并良好预测了二级结构的平均 Phi 值。折叠的能垒是主导性局部结构(如螺旋与发夹)的形成,这些结构需将非局域氨基酸对带入接触。

关键词

引用

@article{arxiv.q-bio/0311005,
  title  = {Do reductionist cures select for holistic diseases? Adaptive chronic infection, structured stress, and medical magic bullets},
  author = {Rodrick Wallace and Robert G. Wallace},
  journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0311005},
  year   = {2007}
}

备注

13 pages