DiscoVista：基因树不一致性的可解释可视化
种群与进化
2018-02-01 v2
摘要
系统发育基因组学开启了一个不一致性的时代。分析经常揭示基因组不同部分的系统发育之间存在大量不一致，以及使用不同方法或数据分区获得的物种树之间存在不吻合。研究人员常常需要努力理解这些不吻合之处。我们需要可解释的方法来度量和可视化不一致性，包括在替代物种树和基因树之间，特别是对于树的特定焦点分支。在此，我们介绍DiscoVista，这是一个公开可用的工具，可创建一套简单但可解释的可视化。DiscoVista有助于量化不一致性的程度及其部分潜在原因。
引用
@article{arxiv.1709.09305,
title = {DiscoVista: interpretable visualizations of gene tree discordance},
author = {Erfan Sayyari and James B. Whitfield and Siavash Mirarab},
journal= {arXiv preprint arXiv:1709.09305},
year = {2018}
}