两个耦合随机过程产生的定向运动：结合蛋白驱动链通过膜纳米孔易位
生物大分子
2015-06-26 v1 软凝聚态物质
摘要
我们研究了由M个单体组成的刚性聚合物在结合颗粒（分子伴侣）存在下通过膜中纳米孔的易位过程，这些分子伴侣结合到聚合物上，并部分阻止聚合物通过孔的回滑。该过程由以下速率表征：k为聚合物通过孔进行扩散跳跃的速率，q为分子伴侣解离的速率，以及q κ为结合速率（结合强度为κ）；除无结合情况κ=0外，分子伴侣的存在产生一个驱动易位过程的有效力。基于(2+1)变量主方程，我们详细研究了扩散易位与结合蛋白（部分）整流之间的耦合动力学。特别地，我们计算了平均易位时间作为各种物理参数的函数。
引用
@article{arxiv.q-bio/0508029,
title = {Directed motion emerging from two coupled random processes: Translocation of a chain through a membrane nanopore driven by binding proteins},
author = {T. Ambjoernsson and M. A. Lomholt and R. Metzler},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0508029},
year = {2015}
}
备注
22 pages, 5 figures, IOP style