三维柔性聚合物的分子伴侣辅助易位

聚合物在结合于聚合物的分子伴侣辅助下通过纳米尺度孔隙的易位是在体内蛋白质中遇到的过程。通过计算机模拟研究相关模型计算量很大。因此，先前的研究要么是三维中的刚性聚合物，要么是二维中的柔性聚合物。此处，我们使用朗之万动力学研究三维中柔性聚合物的分子伴侣辅助易位。我们表明结合机制的差异，更具体地，分子伴侣能否结合到聚合物上的单个或多个位点，导致三维易位动力学的显著差异。我们表明单结合模式导致的动力学非常类似于恒力驱动易位，因此主要由顺式侧（cis侧）的张力传播决定。我们得到易位时间随聚合物长度标度的指数$\beta \approx 1.26$。这一相当低的值可由结合粒子带来的额外摩擦解释。多位点结合导致的易位其动力学主要由反式侧（trans侧）决定。对于此过程我们得到$\beta \approx 1.36$。该值可由我们推导的恒偏压易位$\beta = 4/3$解释，其中易位的聚合物链段在反式侧形成球状团。我们的结果为理解和利用分子伴侣辅助易位铺平了道路，其中微观细节的变化导致涌现动力学的丰富变化。