聚合物的堆积与喷射动力学:约束、聚合物刚性与活性的作用
软凝聚态物质
2024-07-29 v1
摘要
生物聚合物,如 DNA 和蛋白质,通过细胞或核膜实现跨膜转位,是诱发众多生物学过程的关键步骤。转位动力学受到聚合物性质(如刚性)以及胞内囊浆几何形状的影响。本研究旨在探讨聚合物刚性、活性以及不同囊浆几何对被动与主动聚合物堆积与喷射动力学的影响。我们采用 Langevin 动力学仿真进行系统性调查。我们观察到,灵活聚合物的堆积时间快于其半刚性聚合物。有趣的是,对于相对于囊浆尺寸较大的大分子,球形比椭圆形更快地进行堆积和解放,模拟细胞核的结构,暗示了几何优势对于生物聚合物的转位。总之,我们发现,增加活性会加速灵活和半刚性聚合物的堆积与喷射过程。然而,该效应对半刚性聚合物的影响更为显著,凸显了聚合物柔性在这些动力学中的关键作用。这些发现深化了我们对聚合物柔性、囊浆几何与活性之间相互作用的理解,为聚合物堆积与喷射过程提供了宝贵的洞见。
关键词
引用
@article{arxiv.2407.18872,
title = {Packing and ejection dynamics of polymers: Role of confinement, polymer stiffness and activity},
author = {Gokul Upadhyay and Rajeev Kapri and Anil Kumar Dasanna and Abhishek Chaudhuri},
journal= {arXiv preprint arXiv:2407.18872},
year = {2024}
}
备注
10 pages, 9 figures