凝胶电泳中repton模型的扩散常数
软凝聚态物质
2009-10-30 v1
摘要
Repton模型是电泳过程中DNA通过凝胶扩散的“爬行”运动的简单模型。在本文中，我们证明该模型可以映射到一个由两类具有硬球相互作用的粒子在一维晶格上扩散的系统。利用这种映射，我们为该模型制定了一种高效的蒙特卡洛算法，使我们能够模拟比以前研究的系统大两倍以上的系统。我们的结果证实了先前为该模型提出的标度假说。我们还展示了如何使用该模型的粒子版本构建转移矩阵，从而能够精确求解小型repton系统的扩散常数。我们给出了最多包含20个repton的系统的结果。
引用
@article{arxiv.cond-mat/9703096,
title = {Diffusion constant for the repton model of gel electrophoresis},
author = {M. E. J. Newman and G. T. Barkema},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/9703096},
year = {2009}
}
备注
19 pages including five PostScript figures, typeset in LaTeX using RevTeX 3.1