大分子穿过核孔复合物的扩散
软凝聚态物质
2014-06-25 v1 统计力学
生物物理
细胞行为
摘要
核孔复合物（NPCs）是监测细胞质和核质之间运输的高度选择性过滤器。关于 NPC 的塞子提出了两种模型：(i) 它是可逆水凝胶，或 (ii) 它是聚合物刷。我们提出了一种蛋白质穿过塞子的介观模型，该模型足够通用以涵盖这两种情况。蛋白质拉伸塞子并产生局部变形。由此产生的气泡（蛋白质 + 变形）在塞子中执行随机游走。我们发现，对于更快的凝胶弛豫，气泡的扩散更大。此外，在使用适用于聚合物刷的参数时，我们发现扩散系数要低得多。因此，凝胶模型似乎更可能是塞子工作机制的解释。
引用
@article{arxiv.0706.3758,
title = {Diffusion of Macromolecules across the Nuclear Pore Complex},
author = {Rajarshi Chakrabarti and Ananya Debnath and K. L. Sebastian},
journal= {arXiv preprint arXiv:0706.3758},
year = {2014}
}