核孔复合体运输的效率、选择性与鲁棒性
细胞行为
2015-06-26 v1
摘要
所有物质均通过核孔复合体(NPCs)进出细胞核,这是一种兼具高选择性与高吞吐量的高效运输装置。该运输的一个核心特征是被运输因子(携带货物的可溶性运输因子)与排列在 NPC 内的柔性、非结构化蛋白质丝状物(称为 FG-nups)的结合。我们将运输因子的动力学及其与柔性 FG-nups 的相互作用建模为有效势中的扩散,结合了解析理论与计算机模拟。我们表明,运输因子与 FG-nups 的特异性结合促进了运输并提供了选择性机制。我们表明,运输的高选择性可由对结合位点和 NPC 内部空间的竞争来解释,这种竞争筛选出运输因子而非仅与 NPC 非特异性相互作用的其他大分子。我们还表明,由于 FG-nups 的柔性,运输对 NPC 中 FG-nups 数量和分布的变化相对不敏感;这解释了近期实验中删除多达 NPC 总质量一半仍未 abolished 运输的现象。值得注意的是,我们证明了先前已确立的 NPC 物理与结构特性可解释核质运输的观察特征。最后,我们的结果提出了构建人工纳米分子分选策略的建议。
引用
@article{arxiv.q-bio/0609043,
title = {Efficiency, selectivity and robustness of the nuclear pore complex transport},
author = {A. Zilman and S. DiTalia and B. T. Chait and M. P Rout and M. O. Magnasco},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0609043},
year = {2015}
}
备注
38 pages, six figures