DHX36 介导的 G-四链体解旋是否不依赖 ATP？
生物大分子
2019-09-24 v1 生物物理
摘要
Chen 等人解析了牛源 DHX36 与含有 G-四链体（G4）和单链 DNA 片段的 DNA 结合的晶体结构。他们认为所提出的机制可能代表描述 G4 解旋螺旋酶如何识别并解旋 G4 DNA 的通用模型。他们的结论很有趣，然而我们注意到，他们直接使用了携带 Myc 启动子来源的 G4 形成序列的线性 DNA 底物（DNAMyc）而未预先折叠。这就提出了疑问：他们所获得的结构究竟反映的是 DHX36 介导的 G4 识别与解旋，还是仅代表 DHX36 结合诱导的准折叠 G4 结构。通过结合聚合酶延伸、DMS 足迹法、停流和单分子 FRET（smFRET）实验，我们获得了明确不支持其不依赖 ATP 的单碱基易位结构模型的证据。我们进一步揭示，他们所观察到的 FRET 信号振荡应对应于 DHX36 对 G4 的重复性结合，而非解旋。
引用
@article{arxiv.1909.09965,
title = {DHX36-mediated G-quadruplex unfolding is ATP-independent?},
author = {Hai-Lei Guo and Wei-Fei Chen and Stephane Rety and Na-Nv Liu and Ze-Yu Song and Yan-Xue Dai and Xi-Miao Hou and Shuo-Xing Dou and Xu-Guang Xi},
journal= {arXiv preprint arXiv:1909.09965},
year = {2019}
}