人类端粒 G-四链体多聚体的结构、构象与能量学关联
生物物理
2022-03-15 v1 软凝聚态物质
摘要
G-四链体（G4）是由富含鸟嘌呤的核酸序列形成的螺旋状四链结构，被认为在癌症发生和恶性转化中起作用。当前大多数研究聚焦于 G4 单体，然而在适宜且具生物学相关性的条件下 G4 会发生多聚化。在此，我们探讨由人类端粒序列在溶液中形成的 G4 多聚体的结构、构象与能量特征。我们采用一种结合小角 X 射线散射（SAXS）与圆二色性实验以及粗粒化模拟的新型多技术方法，以提供关于 G4 多聚体大尺度结构特征与稳定性的定量信息。后者显示出显著的 polydispersity（多分散性），其轮廓长度呈指数分布，表明为逐步增长聚合。随着 DNA 浓度增加，G4 堆叠相互作用的强度以及聚集体中单元的数量均增加，其中二聚体与三聚体为最可能的形式。与此同时，观察到 G4 构象的变化。我们的发现提供了人类端粒 G4 多聚体的定量图像，在实现靶向 DNA 结构的抗癌药物合理设计时必须加以考虑。
引用
@article{arxiv.2203.06521,
title = {Connecting Structure, Conformation and Energetics of Human Telomere G-quadruplex Multimers},
author = {Benedetta Petra Rosi and Valeria Libera and Andrea Orecchini and Silvia Corezzi and Giorgio Schirò and Petra Pernot and Caterina Petrillo and Lucia Comez and Cristiano De Michele and Alessandro Paciaroni},
journal= {arXiv preprint arXiv:2203.06521},
year = {2022}
}