基于尺寸判别的非规范核酸结构定向轮廓探测
生物大分子
2025-05-22 v1
摘要
核酸可形成多样化的非规范结构,如 G-四链体(G4s)和 i-基序(iMs),这些结构在生物过程和疾病通路中至关重要。本研究提出一种创新的探针设计策略,基于啮食尺寸差异,开发了 BT-Cy-1 一种尺度化的唾液探针,通过微调二聚体“厚度”进行优化。BT-Cy-1 在检测 G4s 和 iMs 的结构转变和变异方面表现出高灵敏度,即使在含有过量 dsDNA 的复杂环境中亦能准确检测。应用于临床血液样本,发现肝癌患者与健康者之间 RNA G4 和 iM 水平存在显著差异,首次报告了临床样本中 iM 水平的改变。该工作突显了一种精准的核酸结构轮廓方法,为理解其生物学意义和疾病诊断潜力提供了见解。
引用
@article{arxiv.2505.15035,
title = {Selective profiling of non-canonical nucleic acid structures via size-discriminative supramolecular probes},
author = {Runyu Shi and Dan Huang and Yanxi Wang and Qiuju Zhou and Zhenzhen Zhao and Binwu Ying and Qianfan Yang and Feng Li},
journal= {arXiv preprint arXiv:2505.15035},
year = {2025}
}