具有多重延迟自适应响应的人工基因调控网络设计
分子网络
2016-07-20 v1 生物物理
摘要
具有自适应响应的基因调控网络在生物学中被广泛研究。通常，仅考虑由少数节点组成的模型。它们呈现一个用于激活的输入受体和一个计算自适应响应的输出节点。在这项工作中，我们设计了具有多个受体和多个输出节点、能够产生延迟自适应响应的基因调控网络。该设计通过使用突变和选择的进化算法来完成，该算法最小化由信号形状的自适应响应定义的误差函数。我们给出了几个具有预定义所需自适应延迟响应集的网络构建示例。我们表明，一个输出节点可以根据被激活受体的不同而具有不同类型的响应。此外，由于处理节点可参与多个输入-输出通路，因此呈现了复杂的网络结构。
引用
@article{arxiv.1606.00928,
title = {Design of artificial genetic regulatory networks with multiple delayed adaptive responses},
author = {Pablo Kaluza and Masayo Inoue},
journal= {arXiv preprint arXiv:1606.00928},
year = {2016}
}