降解速率均匀性决定阻遏反馈调控网络中振荡的成功与否
分子网络
2018-02-19 v1
摘要
环振荡器是由相互作用环组成的生化电路，能够产生持续振荡。基因间的非线性相互作用阻碍了对它们功能的解析洞察，通常需要进行计算探索。在此我们表明，尽管表面复杂，不协调反馈环中唯一稳态的稳定性仅取决于降解速率和概括电路反馈的单一参数。具体而言，我们证明产生振荡行为的调控参数范围在降解速率相等时达到最大。引人注目的是，该结果独立于所采用的调控函数或基因数量而成立。我们还推导了振荡作为降解速率和构成环的节点数量之函数的性质。最后，我们通过将一般结果应用于具有两种天然不同降解时间尺度的具体情形，探讨了 mRNA 动态的作用。
引用
@article{arxiv.1802.05946,
title = {Degradation rate uniformity determines success of oscillations in repressive feedback regulatory networks},
author = {Karen M. Page and Ruben Perez-Carrasco},
journal= {arXiv preprint arXiv:1802.05946},
year = {2018}
}