信使RNA涨落与调控RNA塑造负反馈环的动力学
生物物理
2010-07-29 v1 生物大分子
分子网络
摘要
简单调控网络的单细胞实验可能与细胞群体实验显著不同。这种差异源于单个细胞中的随机事件，这些事件在细胞群体中被平均掉了。例如，虽然单个细胞可能在某些蛋白质浓度上表现出持续的振荡，但这种振荡在群体平均中可能表现为阻尼的。在本文中，我们研究了RNA随机涨落作为在单细胞水平产生持续兴奋行为的主导力量的作用。与之前的一些模型相反，我们构建了一个完全随机的负反馈环模型，该模型明确考虑了RNA随机动力学。我们发现信使RNA的随机涨落在翻译过程中可以被放大，并产生持续的蛋白质表达脉冲。受近期对非编码调控RNA在转录后调控中重要性的认识启发，我们还考虑了调控RNA转录本与信使RNA结合并抑制翻译的可能性。我们的发现表明，调控转录本有助于在单细胞水平和细胞群体水平上减少基因表达变异性。
引用
@article{arxiv.1007.4830,
title = {Messenger RNA Fluctuations and Regulatory RNAs Shape the Dynamics of Negative Feedback Loop},
author = {María Rodríguez Martínez and Jordi Soriano and Tsvi Tlusty and Yitzhak Pilpel and Itay Furman},
journal= {arXiv preprint arXiv:1007.4830},
year = {2010}
}
备注
87.18.Vf --> Systems biology 87.10.Mn --> Stochastic models in biological systems 87.18.Tt --> Noise in biological systems http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20365787 http://www.weizmann.ac.il/complex/tlusty/papers/PhysRevE2010.pdf