具有一个或多个环的单个图像的持久性图的置信区域
统计方法学
2024-05-06 v1
摘要
拓扑数据分析(TDA)利用持久同调来量化数据中的环和高维空洞,使其特别适用于检查细胞生物学中细胞图像的特征。在细胞损伤的背景下,随着时间推移,细胞图像中会出现一个环状的伤口,然后逐渐消失。由于缺乏重复样本,对单个图像中的这种环状模式进行统计推断具有挑战性。在本文中,我们开发了一个新颖的框架,利用TDA来估计单个图像中的底层结构,并通过置信区域量化相关的不确定性。我们提出的方法将图像分割为背景和受损细胞区域。然后,利用受损细胞区域内的像素在持久性图(拓扑汇总统计量)空间中建立置信区域。该方法在持久性图上建立了估计,纠正了传统TDA方法的偏差。我们进行了一项模拟研究,以评估所提出的置信区域的覆盖率,并与本文提出的另一种方法进行比较。我们还通过一个细胞修复的真实示例来展示我们的方法。
关键词
引用
@article{arxiv.2405.01651,
title = {Confidence regions for a persistence diagram of a single image with one or more loops},
author = {Susan Glenn and Jessi Cisewski-Kehe and Jun Zhu and William M. Bement},
journal= {arXiv preprint arXiv:2405.01651},
year = {2024}
}
备注
30 pages, 8 figures