表面化学反应网络重配置问题的计算复杂性
计算复杂性
2023-10-27 v2
摘要
我们分析了近期提出的表面化学反应网络（sCRNs）基本重配置问题的计算复杂性；在sCRNs中，相邻物种的有序对根据预定义的允许转移规则（化学反应）非确定性地转变为另一有序物种对。具体而言，对sCRNs模拟至关重要的两个问题是：给定分子构型能否转变为另一给定构型，以及给定细胞在给定转移规则下能否包含给定物种。我们表明，在多种不同设定下（包括相邻物种仅交换而非任意转变的交换sCRNs，以及细胞可改变物种次数受限的k-burnout），这些问题可在多项式时间内求解、为NP完全或PSPACE完全。除极少不同物种数（2或3）外，多数问题至少为NP困难。
引用
@article{arxiv.2303.15556,
title = {Complexity of Reconfiguration in Surface Chemical Reaction Networks},
author = {Robert M. Alaniz and Josh Brunner and Michael Coulombe and Erik D. Demaine and Jenny Diomidova and Ryan Knobel and Timothy Gomez and Elise Grizzell and Jayson Lynch and Andrew Rodriguez and Robert Schweller and Tim Wylie},
journal= {arXiv preprint arXiv:2303.15556},
year = {2023}
}