使用MARTINI力场对ZIF-8沸石咪唑酯骨架进行粗粒化建模
化学物理
2023-05-18 v2
摘要
在本工作中，我们测试了著名的基于粒子的MARTINI粗粒化方法对ZIF-8金属有机骨架的建模能力。评估了其描述结构、晶格参数、热膨胀、弹性常数和客体诱导摆动效应的能力。我们发现MARTINI力场在不同粗粒化程度上均能成功捕捉该MOF的结构性质。环境条件下的晶格参数总体再现良好，但MARTINI 2.0模型倾向于略微高估该参数。所有模型均很好地再现了C11弹性常数高于C12的趋势，尽管没有特定模型在同时准确再现所有弹性常数方面表现突出。在测试的各种可能性中，特定MARTINI版本内珠子类型(flavors)的选择对模拟性质的影响似乎较不关键。在所研究的CG模型中，无一能在MD模拟范围内捕捉到摆动效应。我们强调了具备适当的LJ参数化以建模客体-MOF和MOF-MOF相互作用的重要性。我们希望本工作能成为MOF模拟界使用MARTINI模型的跳板。
引用
@article{arxiv.2302.04263,
title = {Coarse Grained modeling of Zeolitic Imidazolate Framework-8 using MARTINI Force Fields},
author = {Cecilia M. S. Alvares and Guillaume Maurin and Rocio Semino},
journal= {arXiv preprint arXiv:2302.04263},
year = {2023}
}
备注
This article may be downloaded for personal use only. Any other use requires prior permission of the author and AIP Publishing. This article appeared in the Journal of Chemical Physics (Vol.158, Issue 19) and may be found at https://doi.org/10.1063/5.0145924