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通过旋转熵校正扩散分子自由能景观的粗粒度力场

软凝聚态物质 2025-04-18 v1 统计力学

摘要

从分子平衡构象分布中构建准确的原子势能以及相关力场,是粗粒度建模的关键步骤。本文我们证明,为了开发能保持分子平移和旋转扩散的准确的实验坐标力场,必须对观察到的体固定自由能景观进行旋转熵校正,以隔离势能面。我们进一步演示,即使瞬时校正效应很小,所得滞后相关的模型化力也会大幅改变,因此在使用模型化原子势能参数化摩擦系数时,校正尤其重要。

关键词

引用

@article{arxiv.2504.12592,
  title  = {Coarse-Grained Force Fields via Rotational Entropy Corrections to Free Energy Landscapes of Diffusing Molecules},
  author = {J. M. Hall and M. G. Guenza},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2504.12592},
  year   = {2025}
}

备注

9 pages, 6 figures, submitted to PRE