细胞外囊泡中蛋白质的共富集
定量方法
2025-11-21 v6
摘要
细胞外囊泡（EVs）是细胞衍生的分泌物，通过其多样的货物（如蛋白质）介导组织稳态与细胞间通讯。不同的 EV 生物发生途径提示，共享同一生物发生途径的蛋白质存在特异性关联与共富集，而被分隔至不同途径的蛋白质则无关联且共耗竭。然而这些关联规避了常规的蛋白质表达或共表达测量。在此，我们提出并定义成对蛋白质共富集（CoEn）以量化给定蛋白质相对于其整体表达，是否与另一蛋白质共富集或共耗竭。我们利用抗体微阵列测量了 EVs 中多达 240 对蛋白质的 CoEn，以及刺激条件与参考条件间的差异 CoEn（dCoEn）。我们通过调控已知的 EV 生物发生途径验证 CoEn，并发现 dCoEn 能量化扰动与参考条件间的预期变化，同时揭示新变化；在三种模型细胞系及亲本与器官趋向性乳腺癌子代细胞系中的 CoEn 与 dCoEn 揭示了既保守又可变、值得深入研究的 CoEn。综上，我们的结果表明 CoEn 反映并阐释细胞生理与 EV 生物发生，易于测量，并可进一步作为 EV 生物制造中的质量控制及支撑新型 EV 生物标志物。
引用
@article{arxiv.2301.04051,
title = {Co-Enrichment of Proteins in Extracellular Vesicles},
author = {Molly L. Shen and Andreas Wallucks and Rosalie Martel and Zijie Jin and Lucile Alexandre and Philippe DeCorwin-Martin and Lorenna Oliveira Fernandes de Araujo and Andy Ng and Peter M. Siegel and David Juncker},
journal= {arXiv preprint arXiv:2301.04051},
year = {2025}
}