通过柱坐标表征疏水环境中的尖锐溶质-溶剂界面
软凝聚态物质
2024-12-19 v1
摘要
本文表征了疏水环境中的尖锐溶质-溶剂界面,包含三个主要部分。第一是变分隐式溶剂模型(VISM),它建立了任意溶剂化状态的自由能泛函。该泛函的最小化产生了一个偏微分方程,该方程表征了稳定和鞍点溶质-溶剂界面。第二是由两个Gay-Berne椭球疏水分子组成的溶质系统。柱坐标将相应的偏微分方程简化为更易处理的常微分方程,提高了溶剂化效应下溶质-溶剂界面的可计算性。第三,也是本文的创新部分,将尖锐溶质-溶剂界面的计算转化为一个常微分方程边值问题。我们引入了一种有效的方法来数值计算鞍点界面。这在先前的研究中仍然是一个难题。此外,我们讨论了一些定性结果,并研究了界面如何随两个Gay-Berne椭球疏水分子之间的距离变化。
引用
@article{arxiv.2412.13590,
title = {Characterizations of sharp solute-solvent interfaces in hydrophobic environments via cylindrical coordinates},
author = {Hao Xiao},
journal= {arXiv preprint arXiv:2412.13590},
year = {2024}
}
备注
18 pages