约束总变分散溶剂模型的新方法及其溶质-溶剂界面剖面研究
偏微分方程分析
2022-03-23 v1
摘要
在过去十年中,变分隐式溶剂模型(VISM)在溶剂化能预测方面取得了巨大成功。然而,文献中所有现有的 VISM 均缺乏能量最小化溶质-溶剂界面的唯一性,从而阻碍了我们研究界面剖面的许多重要性质。为克服这一困难,我们引入一种新的约束 VISM 并对该模型进行严格分析。我们研究了能量最小化界面的存在性、唯一性与正则性。推导了尖锐溶质-溶剂界面形成的必要条件。此外,我们为约束模型的变分分析开发了新方法,从而对我们先前工作 [55] 中的一个问题给出了完整回答。通过使用若干常见生物分子建模任务展示了模型验证与数值实现。数值模拟表明,由我们新模型计算的溶剂化能与实验数据吻合良好。
引用
@article{arxiv.2203.11285,
title = {A new approach to constrained total variation solvation models and the study of solute-solvent interface profiles},
author = {Zhan Chen and Yuanzhen Shao},
journal= {arXiv preprint arXiv:2203.11285},
year = {2022}
}