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链刚度桥接常规聚合物与生物分子相

软凝聚态物质 2019-11-12 v1

摘要

链分子在工业与活细胞中均发挥重要作用。我们此处的焦点在于对链分子固有刚度的不同建模方式。我们考虑三类刚度——一类对局域弯曲施加能量惩罚(能量刚度),另两类禁止某些链构象类别(熵刚度)。利用细致的Wang-Landau微正则蒙特卡洛模拟,我们研究了刚度性质与自吸引链的基态构象之间的相互作用。我们发现了广泛的基态构象,包括线团、球状、环面、棒、螺旋、类似 β\beta-折叠的锯齿状链段,以及打结构象,使我们得以桥接常规聚合物相与生物分子相。我们推导了由能量刚度与熵刚度产生的持久长度之间的解析映射。我们的研究明确表明,不同刚度扮演不同的物理角色,并对链构象基态的性质有非常不同的影响,即使它们导致相同的持久长度。

关键词

引用

@article{arxiv.1910.06670,
  title  = {Chain stiffness bridges conventional polymer and bio-molecular phases}},
  author = {Tatjana Skrbic and Jayanth R. Banavar and Achille Giacometti},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1910.06670},
  year   = {2019}
}

备注

15 pages, 8 Figures, in press in Journal of Chemical Physics