构建用于物种提及生物医学关系抽取的语料库
计算与语言
2023-06-16 v1
摘要
我们呈现一个手动标注的语料库 Species-Species Interaction，用于在句子级别从生物医学文本中抽取物种间有意义的二元关系，重点关注肠道微生物群。该语料库在评估不同的命名实体识别物种标注器后，利用 PubTator 对全文文章中的物种进行标注。我们使用 BERT 及其生物医学变体抽取物种间关系的初步结果令人鼓舞。
引用
@article{arxiv.2306.08403,
title = {Building a Corpus for Biomedical Relation Extraction of Species Mentions},
author = {Oumaima El Khettari and Solen Quiniou and Samuel Chaffron},
journal= {arXiv preprint arXiv:2306.08403},
year = {2023}
}
备注
Accepted in BioNLP@ACL 2023