将微生物作为特征（第二部分）：关于丰富微生物组-肠-脑轴分析的视角
基因组学
2023-12-11 v2 应用统计
摘要
微生物组-肠-脑轴领域是多学科的，受益于微生物学、生态学、精神病学、计算生物学和流行病学等领域专家的贡献。随着该领域成熟并超越对其相关性的基本证明，研究设计与分析的稳健性及促进可重复性至关重要。作为《将微生物作为特征（第一部分）》的姊妹篇，我们呈现来自相邻及迥异领域的技术，以丰富并指导微生物组-肠-脑轴数据的分析。专为微生物组-肠-脑轴构建的新兴技术亦予以展示。所有这些方法均被置于具体背景中，以应对若干常见挑战：我们如何确立因果性？我们如何整合来自多种「组学」技术的数据？我们如何考量宿主-微生物组相互作用的动态性？本视角面向资深与新兴的微生物组科学家，以在研究的设计构思、分析以及解释阶段协助应对这些问题及其他问题。
引用
@article{arxiv.2305.11703,
title = {Bugs as Features (Part II): A Perspective on Enriching Microbiome-Gut-Brain Axis Analyses},
author = {Thomaz F. S. Bastiaanssen and Thomas P. Quinn and Amy Loughman},
journal= {arXiv preprint arXiv:2305.11703},
year = {2023}
}
备注
For main text: 20 pages, 2 figures; for supplementary analysis: 31 pages and 6 figures. Supplementary analysis generated using Rmarkdown by Thomaz F. S. Bastiaanssen. arXiv admin note: substantial text overlap with arXiv:2207.12475