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BayesTime:面向稀疏纵向数据的贝叶斯函数主成分分析

统计方法学 2020-12-02 v1

摘要

对非线性时间轨迹的建模在许多应用领域(如纵向微生物组分析)中具有根本性的意义。许多现有方法侧重于估计平均轨迹,但评估个体受试者的时间模式也常具价值。稀疏主成分分析(SFPCA)可作为评估非线性轨迹中个体变异的有用工具;然而其在真实数据上的应用常需要谨慎的模型选择准则与诊断工具。在此我们提出一种贝叶斯方法来处理 SFPCA,其允许用户使用带 Pareto 平滑重要性采样(PSIS)的高效留一交叉验证(LOO)进行模型选择,并利用由 PSIS-LOO 估计的形状参数以及后验预测检验进行图形化模型诊断。该贝叶斯实现因而使得 SFPCA 能谨慎地应用于广泛的纵向数据问题中。

关键词

引用

@article{arxiv.2012.00579,
  title  = {BayesTime: Bayesian Functional Principal Components for Sparse Longitudinal Data},
  author = {Lingjing Jiang and Yuan Zhong and Chris Elrod and Loki Natarajan and Rob Knight and Wesley K. Thompson},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2012.00579},
  year   = {2020}
}