一般有限等位基因突变模型的近似抽样公式
概率论
2012-07-25 v3 种群与进化
摘要
遗传分析中的许多应用利用抽样分布，它描述了从群体中随机抽取的DNA序列样本的概率。在单基因座情况下，对于特殊的突变模型，如无限等位基因模型或有限等位基因亲本独立突变模型，在并合下的闭式抽样分布已知已有几十年。然而，对于生物学上感兴趣的更一般的突变模型，目前还没有精确公式。在本文中，考虑有限多个等位基因的模型，利用与并合相关的一个瓮构造，推导了任意不可约复发突变模型或可逆复发突变模型的近似闭式抽样公式，分别取决于不同观测等位基因类型的数量最多为三个或四个。经验证明，当每位点突变率较低时（这对许多生物体成立），本文推导的公式高度精确。
引用
@article{arxiv.1109.2386,
title = {Approximate sampling formulae for general finite-alleles models of mutation},
author = {Anand Bhaskar and John A. Kamm and Yun S. Song},
journal= {arXiv preprint arXiv:1109.2386},
year = {2012}
}
备注
22 pages, 1 figure