DNA发夹折叠的异常动力学
生物大分子
2014-06-03 v1 软凝聚态物质
统计力学
摘要
通过粗粒化DNA模型的计算机模拟，我们展示了DNA发夹拉链动力学是异常的，即特征时间T与发夹长度N呈非线性标度：T ~ N^a，其中a>1。这与拉链模型预测的T ~ N形成鲜明对比。我们表明，异常动力学源于拉链过程中由于闭合链中建立的张力导致的摩擦增加。通过一个简单的聚合物模型，我们得到a = 1+ nu = 1.59，其中nu是Flory指数，该结果与模拟一致。我们讨论了过渡路径时间数据，其中应能检测到此类效应。
引用
@article{arxiv.1406.0213,
title = {Anomalous dynamics of DNA hairpin folding},
author = {R. Frederickx and T. in't Veld and E. Carlon},
journal= {arXiv preprint arXiv:1406.0213},
year = {2014}
}
备注
5 pages, 6 figures; watch video abstract at http://youtu.be/QLotNZaz76c