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解析纤维束成像:利用扩散 MRI 估计局部白质连通性的闭式解

神经元与认知 2017-10-09 v1

摘要

活体人脑中由有髓轴突组成的白质结构主要通过扩散加权 MRI (dMRI) 进行研究。这些长程投射通常通过两步过程进行表征:首先使用 dMRI 估计每个体素内轴突的取向,然后将这些局部取向连接起来以估计推定白质束的空间范围。纤维束成像,即在体素间追踪束的过程,要么需要计算代价高昂的(概率)模拟来对纤维取向的不确定性进行建模,要么完全忽略该不确定性(确定性方法)。概率模拟必然生成有限数量的轨迹,从而给轨迹估计引入“模拟误差”。在此我们引入一种方法,通过解析方式(经由闭式解)获取每个体素的取向分布函数 (ODF),并计算轨迹从某体素投射到每个直接相邻体素的概率。我们通过证明随着模拟种子数量的增加,概率模拟在体素层面收敛于我们解析计算的概率,来验证我们的方法。我们表明我们的方法能从幻影数据集中准确计算出真实转移概率。作为演示,我们将体素转移概率的解析方法整合到 Voxel Graph 框架中,创建了一个用于评估白质结构的定量框架,我们称之为“解析纤维束成像”。长程连通性问题被简化为在图中寻找路径,其邻接结构反映了体素间的解析转移概率。我们证明该方法在计算代价仅为极小一部分的情况下,其性能可与许多当前的概率和确定性方法相媲美。提供了开源软件。

关键词

引用

@article{arxiv.1710.02165,
  title  = {Analytic tractography: A closed-form solution for estimating local white matter connectivity with diffusion MRI},
  author = {Matthew Cieslak and Tegan Brennan and Wendy Meiring and Lukas J. Volz and Clint Greene and Alexander Asturias and Subhash Suri and Scott T. Grafton},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1710.02165},
  year   = {2017}
}