Wako-Saito-Munoz-Eaton $\beta$-发夹模型配分函数零点的解析解
统计力学
2013-08-21 v2 生物物理
摘要
针对一类简单的-发夹结构，获得了 Wako-Saito-Munoz-Eaton 模型态密度的解析公式。在对天然接触结构和局部熵值进行某些简化假设下，也以解析形式获得了配分函数零点。这些零点均匀分布在一个圆上，表现出折叠转变的一级相变特征。在发夹中心区域引入疏水核心后，零点被证明均匀分布在两个同心圆上，分别对应于疏水塌缩和向完全折叠构象的转变。零点分布对疏水核心位置的依赖性显示出清晰的物理诠释。对于具有更复杂天然接触结构的发夹（即链球菌蛋白 G B1 的 16 个 C 端残基），其精确配分函数零点也进行了数值计算，其轨迹同样显示可由同心圆很好地近似。
引用
@article{arxiv.1209.5846,
title = {Analytic Partition Function Zeros of the Wako-Saito-Munoz-Eaton beta-hairpin Model},
author = {Julian Lee},
journal= {arXiv preprint arXiv:1209.5846},
year = {2013}
}
备注
4 pages, 5 figures. An error in Eq.(10) corrected, the caption to Fig.4 revised, and the e-mail address added