引发 Hh 靶基因差异空间表达的生化机制分析
分子网络
2017-09-29 v1 生物物理
摘要
本文分析了先前文献中提出的一些生化机制的转录效应，这些机制试图解释果蝇发育中涉及的 Hedgehog 靶基因的差异空间表达。具体而言，研究 decapentaplegic 和 patched 基因的表达，这些基因的转录被认为受转录因子 Cubitus interruptus (Ci) 的激活子和抑制子形式控制。本研究基于热力学方法，为受竞争（并可能合作）共同结合位点的转录因子控制的基因提供结合平衡加权平均速率表达式，这与 Ci 的激活子和抑制子形式可能的作用方式相同。这些表达式被精炼以产生更简单的等效公式，从而允许对其进行数学分析。得益于此，我们可以评估若干分子过程与组织层面观察到的生物学特征之间的相关性。我们将特别关注高/低/差异亲和力以及无/完全/部分合作如何改变靶基因的激活/抑制区域或引发信号调制。
引用
@article{arxiv.1709.09904,
title = {Analysis of biochemical mechanisms provoking differential spatial expression in Hh target genes},
author = {Manuel Cambón},
journal= {arXiv preprint arXiv:1709.09904},
year = {2017}
}