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多位点突变率的进化约简原理

种群与进化 2013-02-04 v3 谱理论 亚细胞过程

摘要

分析了一个在任意选择下多位点突变率进化的模型。使用Karlin(1982)的技术获得结果,这些技术克服了先前多位点事件模型研究中所需的弱选择约束。发现了一个多变量形式的约简原理:各个位点的约简结果拓扑地组合,产生一个突变率改变曲面,该曲面对于新的修饰等位基因是中性的。新的突变率当且仅当低于该曲面时才能存活——这是Zhivotovsky等人(1994)为多位点重组修饰子发现的超平面的推广。如果某些位点的突变率增加被其他位点的减少所补偿,则这些位点的突变率增加可能进化。修饰子上的选择强度与生殖细胞分裂次数成比例,并随受影响的位点数量增加而增加。在平衡状态下对边缘适应度没有差异的位点不受约简原理的影响,并且在突变率微调下,预计这些位点的突变率将高于处于突变-选择平衡的位点。其他结果包括在乘性突变下不存在“生存力类似、哈迪-温伯格”修饰子多态性,以及平均传递率足以概括修饰子多态性对受选择位点传递的影响。针对像存在突变的重组这样的情况,提出了一个关于偏离约简原理的猜想。可处理性的约束包括:所有位点紧密连锁、修饰子位点初始固定,以及突变分布由可逆马尔可夫链的转移概率组成。

关键词

引用

@article{arxiv.0909.2454,
  title  = {An Evolutionary Reduction Principle for Mutation Rates at Multiple Loci},
  author = {Lee Altenberg},
  journal= {arXiv preprint arXiv:0909.2454},
  year   = {2013}
}

备注

v3: Final corrections. v2: Revised title, reworked and expanded introductory and discussion sections, added corollaries, new results on modifier polymorphisms, minor corrections. 49 pages, 64 references