超 coiled DNA形状的代数几何模型
软凝聚态物质
2022-01-05 v3 数学物理
math.MP
可精确求解与可积系统
生物物理
医学物理
摘要
本文提出一个包含热效应的闭合超 coiled DNA模型。现有模型包含弹性杆。Euler弹性线，即平面上的理想弹性杆，仅有圆和8字形两种闭合形状，作为Euler-Bernoulli能量的极小实现。即便考虑三维效应，该弹性线模型给出的形状也比原子力显微镜（AFM）观测到的简单得多，因为其能量极小点由椭圆函数表示。本文通过对弹性线的推广，得到由超椭圆曲线数据决定的形状，部分地再现了DNA的形状与性质。
引用
@article{arxiv.2105.05635,
title = {An algebro-geometric model for the shape of supercoiled DNA},
author = {Shigeki Matsutani and Emma Previato},
journal= {arXiv preprint arXiv:2105.05635},
year = {2022}
}
备注
23 pages