演化网络模型中的聚合动力学
种群与进化
2009-11-13 v1 适应与自组织系统
分子网络
定量方法
摘要
我们分析了一个相互作用主体(例如前生物化学物种)的模型,这些主体由网络的节点表示,而它们的相互作用被映射为节点之间的有向链接。在快时间尺度上,每个主体遵循基于其他节点催化支持的本征动力学;而在慢得多的时间尺度上,网络通过其节点 - 主体的选择与突变进行演化。在论文的第一部分,我们通过网络演化的特征快照解释了模型动力学,并证实了早期关于网络结构崩溃与恢复的发现。在第二部分,我们聚焦于网络动力学的聚合行为。我们表明,网络结构的扰动被平滑化,使得平均演化可描述为继之以饱和机制的增长机制,而无初始随机机制。对于饱和机制,我们得到了每个节点的平均连接度 与描述平均入度的参数 之间的对数标度关系,该关系独立于系统大小 。
引用
@article{arxiv.0708.4212,
title = {Aggregate Dynamics in an Evolutionary Network Model},
author = {Adrian M. Seufert and Frank Schweitzer},
journal= {arXiv preprint arXiv:0708.4212},
year = {2009}
}