增强采样与自由能计算的变分方法
统计力学
2014-08-29 v3 软凝聚态物质
化学物理
计算物理
摘要
广泛使用的采样方法(如分子动力学或蒙特卡洛)探索复杂自由能景观的能力受到动力学瓶颈的严重阻碍。人们提出了大量解决方案来缓解这一问题。许多方法基于引入作为少量集体变量函数的偏置势。然而,构建此类偏置并不简单。在此,我们引入了偏置势的泛函及其相关的变分原理。使该泛函最小化的偏置与自由能表面存在简单的关系。该变分原理可转化为一种实用、高效且灵活的采样方法。文中展示了多个数值示例,包括三维自由能表面的确定。我们认为,除了数值上的优势外,我们的变分方法为以新颖视角审视采样问题提供了便利的立足点。
引用
@article{arxiv.1407.0477,
title = {A Variational Approach to Enhanced Sampling and Free Energy Calculations},
author = {Omar Valsson and Michele Parrinello},
journal= {arXiv preprint arXiv:1407.0477},
year = {2014}
}
备注
4 pages, 2 figures