一种用于元动力学中集体变量选择的变分构象动力学方法

本文中，我们结合两种强大的计算技术：well-tempered metadynamics 和时间滞后独立成分分析。目标是开发一种用于研究稀有事件和探索复杂自由能面的新工具。元动力学是一种成熟且广泛使用的增强采样方法，其效率取决于集体变量的恰当选择。通常初始选择并非最优，导致收敛缓慢。然而，通过利用时间滞后独立成分分析以及近期构象动力学领域发展的技术来分析此类一次运行中产生的动力学，我们得到了更高效的集体变量，其也能更好地阐明系统的物理。我们在两个范例中展示了该方法的威力。